Bueno en primer lugar no me da muy buena espina que los AVI los transformes con programas de Authoria como el Express.

Siempre suelen haber errores, te aconsejo que utilices el maravilloso y siempre util TMPGEncoder (ojo no la authoria) con esto codificas y en vez de cortar (que tambien puede hacerlo) disminuyes o modificas el tamaño como te guste para que entre sin ningun problema en algun soft de Authoria (TMPGEncoder DVD Author, Sony Architecht 2, Nero Express, Adobe Encore, etc.)

Chau, chau