Hola Fran,
La refrigeración líquida tiene la ventaja sobre la refrigeración por aire de que al poder llevarnos el calor a un gran radiador podemos disipar más watios fácilmente.
Lo que no es una ventaja (o al menos, no algo inherente) a la refrigeración líquida es el silencio. Quiero decir... se puede montar una refrigeración líquida que sea silenciosa y también que sea ruidosa en cuanto a ventiladores, pero la líquida ya parte de la desventaja de tener una bomba de agua que ha de estar funcionando sí o sí y que en caso de ser de calidad apenas se oirá, pero si no es de tanta calidad, hará ruido.
En mi opinión el usar líquida tiene sentido cuando se trata de un equipo overclockeado hasta las trancas, cuando queremos exprimir hasta el último mhz y queremos silencio. En este caso montamos una refrigeración líquida de calidad (nada de "kits de refrigeración líquida").
En otro caso, y esto como digo es mi opinión, meterse en montar líquida es complicarse innecesariamente, pues diseñando bien un equipo, usando disipadores por aire de calidad y teniendo en mente los flujos de aire, se pueden hacer equipos totalmente silenciosos, con procesadores de hasta 125w de TDP e incluso más.
De hecho en los HTPCs y PCs que vendo no pongo refrigeración líquida y no se oyen nada de nada.
Saludos