Estas en un dilema parecido al mio, aunque con ciertas diferencias. Según entiendo de tu mensaje tienes bastante claro el uso que le vas a dar y sinceramente lo que buscas es un NAS, encender y listo, en concreto un NAS enfocado al uso Multimedia. Un htpc y un nas no son lo mismo, un HTC tiene sin lugar a dudas muchas más funciones ya que en definitiva es un pc, pero si tienes claro que lo que necesitas es para un uso de descargar archivos torrent, ver películas, almacenar fotos y/o documentos incluso tener acceso remoto, todo eso te lo da un NAS. Hay muchos tipos de NAS, synology tiene una gran comunidad detrás con un software muy bueno y fácil de usar, Qnap tiene NAS más potentes y en software esta mejorando mucho, cualquiera de estos dos sería una excelente elección.
Cuando se habla de tener un HTPC + NAS, se refieren a tener digamos el pc y el almacenamiento por separado, el HTPC solo tendría el SOFTWARE multimedia, ya sea kodi u otro, pero sin los discos duros dentro, para así contener el calor interno y el nivel de ruido del HTPC. Por otra parte estaría el NAS, que actuaría de almacenamiento puro y duro, siendo totalmente secundario el software propio ya que de eso se encarga el HTPC. De esta manera digamos que liberas al HTPC de parte del trabajo, dejando al NAS casi como de un disco externo se tratará, aunque esto no es del todo cierto ya que el NAS tiene otras más funciones como poder tener acceso a tus datos dentro de cualquier equipo de tu red o de forma remota de y actuando de forma independiente al HTPC.
En mi opinión lo que decanta de un lado u otro es el uso personal de cada uno, siendo a dia de hoy cada vez más habitual el uso de NAS con un buen software, caso del synology, que es muy intuitivo y que para personas con pocos conocimientos se hace relativamente fácil de configurar.
Resumen, si eres un usuario medio-avanzado que te gusta toquetear de todo, ve a por un HTPC. Si eres un usuario que no quiere muchas complicaciones y quiero un aparato de encender y listo mira un NAS.
PD, por supuesto tb puedes montar un HTPC y tener los discos de almacenamiento dentro, hay cajas para HTPC de todos los colores y gustos, por lo que el NAS no te haría falta, lo malo sería el consumo de estar 24/7 encendido, si le vas a dar uso, porque de lo contrario, como ya dije, un NAS con buen software hace igualmente las funciones mas habituales de un HTPC sin problemas.