¿Estas reproduciendo algo que tenga información en el canal LFE?
Es decir, ¿algo en dolby digital, dts o similar? En stereo normal dudo que la tarjeta te haga la gestión de bajos para cortar frecuencia de los frontales y reenviar al subwoofer. Prueba con una película con una pista audio como digo en DD o DTS.
O más fácil, conecta uno de los canales frontales al subwoofer, deberias oir las bajas frecuencias.