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Con REW y el micro medirías la respuesta de cada canal por separado. REW creará una ecualización para cada canal (los filtros) que se guardará en un archivo de texto (uno para cada canal) que después cargaríamos en APO para que los aplique (da igual qué reproductor usemos lo único a tener en cuenta es que use la salida Directsound).

Puedes hacer una ecualización para un equipo y otra para el otro (midiendo con REW en cada sala) pero tendrás que cargarlas manualmente según uses uno u otro (se podría hacer automáticamente pero ya es más complicado).

Dirac básicamente funciona igual primero mide la respuesta y después crea un archivo con la ecualización (los filtros) que en este caso se cargaría en el Dirac Audio Processor o en el plugin VST.