Hola.
Si realemente tienes problemas con el sub, entonces si merece la pena poner un aislante debajo. Si no te vibra en el suelo y ves que funciona bien dejalo como está. El que tengo ahora viene con puntas de desacoplo, pero el anterior venía con unas patitas con terminación en goma.
En cuanto a las puntas de desacoplo de las cajas hay muchas opiniones. Yo mis anteriores cajas las tenía desacopladas sobre una losa de piedra ( cortada a la medida) para que no pincharan el parket. En teoría "mejoraba los graves" y cuanto menos superficie de contacto tuvieran con el suelo mejor. Cuando una supuesta mejora no cuesta mucho dinero, pues la haces y te quedas tranquilo. Si las cajas traen puntas y por pocos € o con un poco de bricolage casero, las puedes poner, pues ponlas. Ahora , gastarse un dineral en puntas pues me parece una chorrada, porque tampoco está tan claro que lo vayas a notar. En este mundo hay mucho esoterismo y mucha "fantasia".
Saludos