Lo que te ocurre puede sea que ese sistema de corrección capa la zona alta (es típico en algunos A/V aplican una caída progresiva frecuencíal desde unos 5khz hacia arriba; u otros en esa zona no tocan nada). Personalmente en acústicas más o menos neutras y punto de escucha mejor de 2m prefiero la respuesta lineal... y con estos sistemas de corrección automática el sonido no me termina (aunque algunos tienen la opción de "tendencia a lineal"). Aún así, sigo prefiriendo la EQ externa porque logró mejores resultados.

Sobre el tema fase, en un sistema multicanal un A/V ayuda en el sentido de que, tal y como te ha comentado lemg, puedes corregir distancias, delay, etc... o dicho de otra manera, podrías combinar parte de los ajustes del A/V con una EQ externa complementaria (suma con la que obtener el balance final que no logras sólo con la EQ de tu A/V).

Un saludete