Yo creo que SI hay diferencia y se debieran evitar modificaciones tan extremas, abordando el problema de otra manera.
Desde el punto de vista real, sin ceñirnos a la pregunta estricta, yo consideraría lo siguiente:
Estamos viendo una gráfica en un único punto, suma de al menos dos subs, tenemos un gran pico, es muy poco probable que no tengamos valles por cancelaciones, en las proximidades del punto de escucha, proporcionales a los picos.
Tanto un ultracurve, como mathaudio, ecualizan a partir de una única medida, no en medidas promedio alrededor del punto de escucha.

Yo estoy haciendo pruebas y por simplificar, he pasado el Audyssey con una sola medida, aún sabiendo que se desaconseja totalmente no completar las 8 medidas.
Lo que noto en esos casos es que tengo un punto de escucha muy muy focalizado, pero en cuanto muevo la cabeza unos centímetros "desaparece la magia".