Pelayo, si se trata de escuchar CDs siempre sonaran mejor cuando la entrada es digital como es el caso con el coaxial, que si lo haces por analogico.

Otra cosa es el caso, bastante usual con los discos en alta resolucion (SACD y DVD-A) con los que la mayoria de los fabricantes ofrecen mas a menudo conexiones analogicas y, por tanto, es la unica via posible para la mayoria de nosotros.

Asi pues, no es extraño que tus CDs suenen mejor conectados por via digital.