que aparato de sony va a leer mkv?? perdon si no lo he entendido bien.
La play 3 no lee mkv, lo que si hay es un conjunto de utilidades que te permiten pasar un mkv a mpeg4. vob y el formato de blueray (no me acuerdo ahora del nombre). Los cuales si lee la PS3 sin ningún problema.

De hecho, hay algunas pelis en HD por ahi en estos formatos para meterla directamente a la PS3, pero me parece que en la mayoría de los casos tendrás tú que hacer la conversión.

PD: En formato mpeg4 al parecer no acepta archivos mayores de 4GB, con lo cual si la pelicula ocupa más y quieres pasarla en este formato, tendrás que dividirla en trozos.