Buenas.

Lo dicho por Juan28, lo normal es que reproduzcas el video y se vean las dos imagenes en pantalla completa, una al lado de otra, le das al boton de 3D de la tele, o en el menu 3D y le dices que es un video SBS, entonces generara la imagen 3D, te pones tus gafas y a disfrutar.

Sobre la resolucion que tienes que poner en el pc, pon 1080 o 720.

Un saludo.