Eso da igual, para asegurarte de que los tiros no vayan por ahí, entra en la bios (tecla esc o F2 creo) y en el apartadp Boot (arranque si es en español), define como primer dispositivo de arranque, el ssd donde tienes instalado el Windows.
Listo,ya pude instalar el sistema operativo y ahora ya inicia en menos de 10 segundos.