Si buscas en Internet imágenes de "atx 24 pin connector" verás que hay un pin 'NC' (not connected) ... por lo que no veo tengas que preocuparte.
Por otra parte, regla "burra" hablando de fuentes de alimentación, que un pin 'falte' casi nunca va a generar una hecatombe, lo más que el bicho no arranque ... pero cuando veas un pin 'de más' o 'descolocado', ahí sí preocúpate ... ;-)

Saludos.