Lo mas importante a mi parecer es la seguridad, para esto los discos de sistema deben estar montados en espejo, si usas ssd asegúrate que incorporan una controladora con recolector propio ya que Windows salvo que comente algo un forero contrario solo funciona bien en ahci con el trim, Monta otro raid 0 para los discos de datos con discos mecánicos y sino tienes recolectora en los ssd puedes direccionar a estos los temporales como segunda solucion. No precisas a mi opinión un gran procesador, un i5 básico será bastante, no son procesos que tiren de procesador, metele bastante ram, 8 minimo, si puedes gastarte ahí y poner una cantidad suficiente puedes eliminar el archivo de intercambio y te ira mas fino. La caja es lo de menos, que ventile bien y sea amplia, la fuente crucial, ponle una buena, siempre es una buena inversión, la placa base supermicro no hace falta que sea tope de gama, una básica para las necesidades que comentas vale, pero la fiabilidad es básica para evitar disgustos, el SO puedes optar por un Windows server, y lo mas importante asegúrate que la instalación la lleva a cabo un profesional acostumbrado a este tipo de instalaciones.