Perdona te escribí de memoria, la versión que tengo es la 3.4, la puede descargar desde este enlace " Index of /videotools/mkvtoolnix/win32/ " y en un principio no debes cambiar nada, solo añadir el archivo que desees recodificar clicando en add, indicandole la ruta de los archivos, clicando dos veces en el archivo elegido y si quieres quitarle algún audio o texto desmarcar la pestaña correspondiente, y como ultimo clicas sobre star muxing y a esperar. Suerte.