Ya lo he solucionado!!!
Os lo explico como por si a alguien le ocurriera alguna vez...
1-He buscado la pagina Torrent donde encontré el archivo y la he guardado en "Favoritos"
2-He ido al BitComet y he marcado la descarga... después le he dado a "Eliminar (SOLO ELIMINAR TAREA)"... asi los archivos descargados anteriormente siguen en "Downloads"
3-He vuelto a "favoritos", he buscado la descarga, y lo he puesto a descargar otra vez, de manera que ha comenzado a contar lo que habia descargado, y el "contador de %" ahora me marca correctamente!!!
Gracias Tassadar y un saludo a todos!