El 'pendrive' es más un formato físico de producto que una tecnología. Una unidad SSD es raro que la encuentres en formato 'pendrive', sí con conexión USB, pero a nivel físico son más grandes, ya que requieren de más módulos nand, controlador más avanzado, posible memoria cache intermedia, etc ... por eso no son comparables. Tú buscas una unidad SSD, no un pendrive.

Respecto a la desfragmentación, ..., lo únido que puede sufrir de fragmentación es un HDD. Cualquier unidad basada en memoria nand no es susceptible de fragmentación, por lo que no le veo sentido hacerlo, pero lo mismo puedes forzar al sistema a desfragmentarla, ahora bien, entiendo que fuerzas un monton de escrituras en el mismo para obtener beneficio cero. ¿tiene sentido perder tiempo y gastar el disco para no obtener ninguna ventaja?, yo creo que no.

En un disco duro lo que hace el sistema es reordenar los archivos de forma consecutiva dejando todo el espacio libre en un gran 'hueco', que permita que las escrituras y posteriores lecturas sean secuenciales. A los disco duros lo de andar moviendo las cabezas por el plato del disco no le gusta mucho y es bastante lento.

Desfragmentar un disco no debe afectar a los datos guardados. Lo que nunca he hecho es andar desgfragmentando un disco duro externo USB, que entiendo debe ser un proceso muuuuy lento por tener que ir moviendo archivos de un lado al otro del disco y, si tiene que guardarlos temporalmente en la memoria del ordenador, todo eso son datos a escribir y leer por USB ... puff. Lo dicho, a nivel de perder datos no le veo riesgo, no así a la hora de perder el tiempo. :-)

Saludos.