A Kodi si puedes guardarle los addons y sus configuraciones, hay addons que hacen copias de seguridad uno es Backup lo encontraras en el repositorio oficial de kodi. Add-on:Backup - Official Kodi Wiki
Te instalas el addon Backup en kodi, te haces un backup en el USB. Cuando vuelvas ha instalar kodi, solo tienes que instalar primero el addon Backup, luego restaurar el backup que tienes en el USB y tendras kodi como antes, con todos sus addons.