Hola!

No conozco Pinnacle 9, pero por mi experiencia con otras aplicaciones parecidas (Premiere, Ulead, etc) todos esos ficheros son utilizados (como temporales) para la confección del DVD en si mismos. La teoría (de veras no he usado tu aplicación) es que el DVD final te lo Haya incluído en una subcarpeta llamada VIDEO_TS, y esa es la que debes grabar "a pelo" en tu nuevo DVD.

Compruebalo, tal vez esa sea la solución.

Saludos!