No se como agradecerte una vez más, tus consejos sobre los tochos (mentales y forovirtuales) que me marco jajaja. Perdona mis absurdudas, pero al final entre novato y demasiada información, uno se acaba liando jeje.

Lo primero de todo, decir que estaba dando por hecho que una placa ATX no me cabría porque pensaba que sería forzosamente más ancha. Buscaré entonces placas que tengan el ancho de la mía (que me parece que son 24/25 cms) y cubran más parte hacia abajo.

En segundo lugar, agradecerte la explicación y el link referente al tema de los RAIDs. Desde luego, se me han quitado las ganas del raid 5 jeje. Creo que optaré por respaldar sólo aquello importante e irrecuperable, y sino, a base de duplicar hdds.
Una pequeña aclaración, donde dices:

Dicho esto, yo tendría en tu caso el SSD para el sistema operativo, los datos en un RAID 0 (o mejor, en dos discos independientes pero sincronizados por software)
Será RAID 1, no? Y en cuanto a discos independientes pero sincronizados por software, te refieres a guardarlos "manualmente" en uno, y por medio de algún software, como podría ser Cobian Backup (que es el que uso), hacer el respaldo en el otro disco? Por cierto, hacer raid por software en Windows, es mejor/peor que con linux o con la controladora de la placa?

Muy bonita esa placa, pero efectivamente, se me va de precio jeje, de hecho mi tope está en los 100/120 euros para la placa, y ya bastante me parece xD. Creo que usaré todos los puertos sata de la placa que elija y cuando los agote, tiraré de la controladora con los otros 4 puertos sata. Respecto a que la controladora esté situada contiguamente con la gráfica ¿ves, a priori, algún problema?.
A simple vista he encontrado esta placa, que cumpliría con los puertos sata y con tener un pci x1 alejado, pero creo que se me va unos centímetro de ancho (cuando llegue a casa, mediré al milímetro la mía actual). Si no supusiese un problema de refrigeración/ruido, tiraría por cualquier otra más barata o de otra marca y con más opciones.

Muchas gracias de nuevo y un saludo!