Hola. Para grabar archivos de gran capacidad en un pendrive, creo que más de 2 Gbs, este debe estar formateado en NTFS. No te vale FAT ni FAT32.

A la 2º pregunta ni idea. Ya me gustaría saberlo para grabar los mkv en dvd´s.

En cuanto a lo último, pues la verdad no tengo mucha idea. Si no me equivoco 720 es HD Ready, y la calidad es mejor que la del Dvd. Después está el Full HD o HD Full Ready, según la compañia usa una u otra manera de llamarlo, que es el 1080. Despues esta lo que llamen interleave y progresivo o algo así. Si buscas por el foro, todo esto del HD, Full HD, interleave y progresivo, seguro que en más de un hilo está explicado.