Elejir entre HTPC o Boxee Box

El i3 me parece bien
El tema memoria, con 2Gb basta, pero si te gastas 500 €... casi pones 4 Gb y aprovechas el dual channel
El disco duro: pon uno que sea de 5900 rpm (el WD Caviar Green o el Seagate LP 5900 rpm): algo más frescos y menor ruido y consumo. Y el tema de rendimiento bastante parecido y sobrado.

El tema tamaño Mini-itx: tengo un sistema HTPC en mini-itx y ahora creo que mejor hubiese elegido una micro-atx: menos apretados los componentes y "respiran" mejor...

La caja es según gustos particulares. Particularmente no sería la que yo elegiría. Elegiría una silverstone: si quieres mini-itx la Sugo SG06. Si la quieres micro-atx la Grandia GD05 o 04. Y me elegiría fuente aparte si puede ser.
En el refrigerador de la CPU: empieza con el de serie bien regulado y después, si no te convence, le añades uno específico.

Gráfica: si vas a jugar a algo esa gráfica es aceptable (sencilla, pero aceptable).
Si no vas a jugar a juegos modernos y lo quieres para HTPC puedes probar con la integrada de Intel (no clavarás los 24p, pero igual ni te importa...), o puedes poner una ATI HD5450/5570/5670 y te sobra (yo tengo una 5450 pasiva...y perfecto). Te ahorraras dinero, calor, ruido y consumo.

Saludos