Hola Gurutzo,
Si vas a usar linux da igual que la gráfica soportase BD3D porque para eso forzosamente necesitas Windows, pues no hay software en Linux ni en MAC OSX que reproduzca BD3D.
Dicho esto, lo importante sería que la gráfica te diese correctamente los 23,97 fps, y creo que esa gráfica lo hace (no estoy seguro porque me conozco bastante bien las ATI y las Intel, pero no tanto las nVidia).
Saludos