Si solo, única y exclusivamente vas a tener un equipo es mejor opción tener el NAS y el HTPC en un mismo sitio. Si tienes más "clientes", es decir, otros ordenadores, tablets, móviles, portátiles, HTPC's o lo que sea es mejor opción un servidor dedicado (tienes el HP N54L a 175 euros en Amazon, insuperable en precio). Lo pones en el lugar más alejado de la casa a donde llegue el cable para que el ruido no sea un problema. Con eso consigues:

- El precio es similar al montarse un HTPC+NAS (caja grande, etc.).
- Mejora estética clarísima al no tener que depender de cajas grandes donde quepan muchos discos duros. Tener un equipo chulísimo con una caja mini como la Origen M10 o la MS-Tech CI70 en el salón es una gozada.
- 24/7 descargas y disponibilidad de tus archivos, películas y lo que sea.
- Nube privada siempre online.
- Posibilidad de miniaturización del HTPC reproductor, al no tener la necesidad de "caberle un disco duro".
- Posibilidades infinitas de contenido: ya no tienes que preocuparte nunca más de haber comprado un pincho Android, un NUC, una Pi, un reproductor multimedia, etc. y decir.."joder, ahora a tirar de discos duros USB's" pues no, el contenido lo tienes siempre en otro sitio y siempre disponible.
- Temperatura, calor y ruido: el ruido al tenerlo en otro cuarto o incluso en la cocina o desván provoca que sea 0 en el salón (mejor dicho, el que haga el HTPC). En cuanto a calor es normal, los NAS son equipos de muy muy bajo consumo y que suelen tener muy poca potencia -pues no van destinados a reproducir, solo a servir- y por lo tanto el calor que generan es bajísimo. Además, al no tener que poner discos duros mecánicos en tu HTPC hará que el calor (y por ende, el ruido) que desprenda éste sea mucho más bajo....con lo que hará falta menos ruido para disiparlo.
- Es capaz de con una tarjeta sintonizadora, "servir" servicio de TV a toda la casa entera. Es una pasada ver el plus en la tablet o un canal de la TDT, sabiendo que no te hace falta nada en la tablet, portátil o móvil porque la sintonización se hace desde el NAS. Todo esto es idéntico a lo que pasa con las películas, series y demás contenido que está en el NAS y disponible para toda tu red.

Te dejo un post que he puesto esta mañana sobre las funcionalidades que tiene, por ejemplo, mi NAS:

- Tasas de transferencias (tengo red gigabit) cercanas a 95 MB/s sostenidas mediante el uso de NFS (en lugar de Samba) y con los Jumbo Frames activados en todos los PC's que lo soportan.

- Servidor accesible vía control remoto por VNC con el cliente correspondiente en cada equipo.

- Servidor accesible vía control remoto desde cualquier navegador de internet.

- Servidor accesible desde la intranet y desde cualquier lugar del mundo mediante NO-IP y Logmein Hamachi/TeamViewer. (esto es una pasada).

- Servicio de Nube propia accesible desde cualquier lugar del mundo.

- Subida a trackers limitando el upload según las horas que quiera.

- El NAS se levanta automáticamente para grabar cualquier contenido de TV que algún cliente haya pedido desde XBMC y una vez grabado se vuelve a suspender.

- 2 tarjetas TDT USB que dan servicio de TV a cualquier dispositivo (móvil, tableta, portátil, ordenadores, etc.) con internet, de momento solo dentro de casa. 1 tarjeta satélite que hace que pueda ver más de 1600 canales en cualquier dispositivo conectado a la red de mi casa: móvil, tablet, portátil, HTPC's, PC's de cada cuarto, etc. Qué gozada ver por las noches la TV desde mi tablet sin tener que tener en cuenta nada más que la batería xD.

- Servicio en la nube externo con 25 Gb de Dropbox sincronizado con todos mis equipos, tanto dentro como fuera de casa.

- Varias aplicaciones de utilidad instaladas en el NAS: Clonación de discos al momento, Salud del Disco Duro (GSmartctl), clonación de cualquier disco duro de cualquier ordenador conectado a la red de casa, visualizador de recursos y un largúisimo etcétera.

- Varios servicios de red con entorno gráfico para configuraciones: Samba (SMB), NFS, FTP, SSH, DDNS, etc.

- 9 TB en tres discos duros de 3TB cada uno (W.D. Green) que se montan automáticamente al iniciar el servidor.

- Testeos de los discos duros de manera automática (sí, de los 3), un test corto cada lunes, miércoles y viernes y uno largo 1 vez por semana, los resultados de los test se me mandan automáticamente por email y se muestran en el escritorio mediante Conky.

- CERO ruido, solo hay UN ventilador (un Nidec GT de 1150 rpm) regulado a 500 rpm mediante fancontrol (que maravilla de programa) y cuyos datos se me muestran nuevamente en conky (para saber si todo está bien o si el ventilador, por X motivo se me ha apagado).

- Sistema realmente fresco, el Atom pasivo se queda entre los 40-45 grados, le metas la caña que le metas. Los Discos duros, para tener un sistema de refrigeración basado en UN ventilador de 500 rpm se muestran bastante fresquitos: 37 y 40 grados respectivamente, trabajando al 100% aumentan solo 1 o 2 grados más las temperaturas.

- Servidor de medios digitales instalado para poder usar DLNA en los equipos que lo soporten (la TV, aunque esto no lo uso para nada, para eso tengo el HTPC).

- Red Gigabit DUAL, mientras está usándose como Servidor/NAS el equipo está dando conexión a internet compartida con el ordenador de mi hermana (con un cable cruzado que pasa de su cuarto al mío), ya que la señal Wifi le llega fatal y encima el router está a 25 metros. Como el NAS está encendido las 24 H del día pues siempre tiene internet.

- El servidor me avisa tanto al mail como al móvil si hay algún incidente importante, véase: subida de temperatura del equipo/sistema por encima de los 70 grados (jamás ha pasado), el ventilador se ha apagado, el disco del sistema tiene algún error, fallos en los test de los discos duros de almacenamiento, etc.

- Cliente Bittorrent (Transmission) que se inicia como Tray al inciar el sistema, también puedo "ver" y pausar, cancelar o eliminar las descargas del mismo desde cualquier ordenador de la casa desde el propio add-on de XBMC.

- JDownloader configurado con cuenta premium de filenium se inicia al iniciar el sistema y en este caso ocurre lo mismo que con Transmission, desde cualquier PC puedo hacer lo que quiera.

- Suspensión del equipo automática y levantamiento del mismo también automática cuando algún cliente de la red lo requiere (para ver la TV, cualquier película, imágenes, vídeos caseros, etc.), AUTOMÁTICAMENTE, sin hacer nada (aunque el 99% del tiempo el equipo está encendido).

- ¡CONKY! Esto sí que es una caña, pues muestra en el escritorio y con un diseño gráfico chulísimo el consumo de procesador, del sistema, el espacio libre en los discos de almacenamiento y en el de sistema, análisis de los discos duros, análisis de la red (si estoy subiendo o bajando algo y la velocidad a la que se está ejecutando), temperatura del sistema de los tres discos duros de almacenamiento y del SSD así como del equipo, procesos que más están usando la CPU, carga de RAM, etc.

- Antivirus ClamAV (aunque no se inicia con el equipo, pues solo ocupa memoria/cpu, ya que en Linux práctiamente no hay virus, aunque siempre está bien tener un antivirus en el equipo).

- Shorewall, Firewall que permite crear perfiles avanzados y está configurado perfectamente con todos los equipos de la casa.

- Discos duros de almacenamiento (W.D Green de 3TB) parcheados para que el aparcado de cabezales sea cada 300 segundos y no cada 8 como viene por defecto.

- El consumo del equipo es despreciable: la CPU tiene un TDP de 13W y la placa de 4W (17W), trabajando con el servidor diariamente dudo muchísimo que pase de los 6-7W (sin discos, los cuales según W.D es de 6W en carga y menos de 1 en IDLE, así que sumad...).

Todas esas ventajas desaparecen si y solo si tienes UN SOLO equipo en casa (el HTPC+NAS), si tienes más de dos (3 por ejemplo) a mi parecer la opción de NAS+HTPC ya es lo suficientemente atractiva como para optar por ella.

Un saludo.