Por supuesto que no pasa nada por conectar dos ventiladores diferentes a un mismo conector, de hecho el único problema que puede existir es que pongamos demasiados ventiladores a un mismo conector y excedamos la potencia que puede dar el conector, corriendo el riesgo de quemarlo.

Como ya decía yo anteriormente, la unica historia de poner dos en el mismo conector es que si son diferentes irán a velocidad diferente.

En cuanto a conectar dos ventiladores diferentes, que ambos sean PWM, no lo he probado, pero la lógica dice que igualmente girarán a diferentes velocidades, siempre a una velocidad proporcional a su velocidad máxima y que estará definida por el intervalo de los pulsos.

Saludos