Yo lo monto como indica el fabricante, que es con los heatpipes mirando hacia los bancos de memoria, pero vaya que da igual. La pasta térmica hay ríos de sangre sobre el tema, cada uno tiene su manera: pegote en el centro, "X" en el procesador, esparcida como una fina lámina por toda la superficie...ponlo como quieras, no afectará al resultado final. Los tornillos apriétalos bien, pero no seas tan burro de apretarlos tanto como para doblar la placa (que lo he visto alguna vez, jeje).
Un saludo.