Hola Yorick,
Los AMD son calentitos, es lo que hay, jeje, incluso configurándolo a 45w.
Yo he montado algunos de 45w de TDP en cajas LC-Power, y con la modificación de caja (instalando el filtro) e invirtiendo el flujo de aire del ventilador para que saque el aire caliente de la caja quedan bastante bien, con un nivel de ruido en carga que queda por debajo de un disco duro de 5200 rpm, y esto con un Kozuti.
Con el Big Shuriken 2 lo tenemos aun más fácil, pero es necesario que el calor se evacúe eficientemente de la caja, si no, tendremos ruido sí o sí. La caja ML05 no la he montado, pero al llevar perforaciones en la parte superior, debería ayudar en esto, ¿has probado a ponerle el ventilador sacando aire hacia arriba? (tendrás que calzar ligeramente con material algo esponjoso las 4 esquinas del ventilador para que no roze con las aletas del disipador).
Como ya he comentado, monté un 7850k en una ML04, con un Big Shuriken 2 + Enermax de 14cm sacando aire y modificación de caja, y configurado con TDP de 95w se ponía calentito, siendo necesario que el ventilador acelerase de las 300rpm que tenía mínimas, aunque el nivel sonoro quedaba por debajo del disco WD GP.
Con un procesador del mismo TDP, y con el ventilador de 12cm original del BS, estamos en una situación un poco peor, sobre todo si la caja no evacuase bien el calor (que por las fotos creo que andará bien sin tener que modificarla).
En cuanto a los perfiles, suelo poner los ventiladores a velocidad de arranque (lo mínimo posible) hasta los 50 grados aproximadamente, y a partir de ahí subir muy ligeramente cada 5 grados, con la temperatura máxima coincidiendo con la que indica el fabricante como máxima para esa APU.
Saludos