Normalmente al poner porcentajes muy bajos (por debajo de la velocidad de arranque del ventilador) es como si le pusieras esa velocidad minima, que por cierto, que no es exacto, porque en algunas placas con el mismo ventilador te puede poner un poco más o un poco menos.

También hay conectores donde sí que se puede quedar parado el ventilador, el otro día mismo hice eso con una caja GD05, le puse que los ventiladores de caja estuviesen parados hasta los 45º

Saludos