Yo también tengo ese emulador y el mando cutre que tengo funciona bien e incluso uno con cable de la 360, aver, vete a CONFIG-INPUT 1-SET KEYS y a continuación sigues las instrucciones que te van dando, tocas la tecla donde quieres que sea arriba, abajo, derecha, izquierda... etc, a ver si hay suerte.

Un saludo