Hola.

Por si alguien se encuentra con este problema, por suerte he conseguido ordenar de nuevo los canales. Se me ha solucionado al ordenarlos después de hacer la sintonización de los canales, una vez acaba la sintonización te da opción a editarlos, al hacerlo seguido, en el mismo paso, se han ordenado y ha mantenido la señal de los canales qué antes se me perdía y puedo reeditar sin problema el orden después.