No he tenido nunca ese problema, pero te puedo aconsejar que pruebes el Dr. divx, tiene varias opciones en cuanto al aspect ratio, donde puede usar *el 4:3,16:9 o 1:1, y lo puedes previsualizar antes de elegir, así podrás saber cual te conviene.

Prueba a ver ke tal y suerte.

Un saludo.