¿Con qué dispositivo estás reproduciendo los ficheros? No obstante, tu AVR no es compatible con Dolby Atmos. Lo estará pasando a Dolby Digital normal.
Por otro lado, ¿a qué conectores tienes puestos esos altavoces delanteros elevados? ¿A los surrounds? Te estarán sacando sonidos que tendrían que salir a los lados o por detrás, por delante. Calibra primero con el micrófono y pasa el YPAO.