Hay varias cosas a tener en cuenta en este tema.
Se compara la pista original HD con la pista en castellano AC3 y esta comparación, aunque para mí es correcta porque es lo que hay es la pista que trae en español no hay otra, es "injusta" porque la mezcla no es la misma.
Para comparar un audio HD con un AC3 en condiciones "justas" tendríamos que comparar la pista original HD con la pista original AC3 o la pista en castellano HD con la pista en castellano AC3 y aún así también pueden ser distintas (puede que una de ellas tenga el central o el canal LFE con más ganacia por ejemplo o que se haya aplicado aposta algún tipo de compresión dinámica).
Objetivamente la pista HD es mejor, cualquier audio sin pérdida es mejor que otro con pérdida. Que las diferencias sean audibles es otro cantar lo mismo pasa entre FLAC y mp3.
Si tengo que quedarme con una me quedo con la HD porque peor que la otra nunca va a ser, como mínimo es igual (y puede que en algún aspecto incluso sea mejor a oído), me quedo más tranquilo es la máxima calidad objetiva. Yo veo siempre en VO pero no me parece bien (y es de lo que va el hilo) es que a estas alturas aquí no dispongamos de esa pista HD en castellano (y sí en francés, italiano, etc).