Que te vayan a saltos es bastante comprensible. Piensa que el reproductor interno de la tele no es tan bueno como un reproductor específico y tu disco duro externo ni siquiera es multimedia,por lo que es normal que ciertos codecs no se decodifiquen correctamente, además mover un mkv requiere un gran flujo de datos y cuanto peor es el reproducto, más opciones de que te vaya a saltos. La única opción que tienes es codificar todas las películas con los códecs de la que te va bien o comprarte un buen reproductor, la culpa no es del televisor. Lo del mp4 no se si es que a través de usb no lee ese formato o que puede ser, mejor que conteste alguien que lo haya probado.