Imagino que tienes conectado el Apple TV 4k al Yamaha, y luego el Yamaha al televisor a través del puerto HDMI con ARC.

Si en la Apple TV la dejas con el valor por defecto, sacará Atmos cuando la película está en Atmos (hay bastantes en iTunes, y también unas cuantas en Netflix. Ojo, que el Atmos casi siempre es en inglés, no en español). Todo lo que no sea Atmos, lo convierte a LPCM multicanal, que es un formato sin pérdidas. Si estás escuchando una película que va en Dolby 5.1, entonces lo convierte a LPCM 5.1, y lo envía así al amplificador.

Luego puedes forzar que todo el sonido se convierta a Dolby 5.1 (y entonces el Yamaha recibe, claro, Dolby 5.1), o a estéreo (y entonces recibes en el Yamaha los dos canales que lleva el estéreo).

El eARC, si lo tiene el televisor y el receptor, perfecto. Si no, es compatible tener uno con eARC y otro ARC, se entienden en ARC.