Yo he probado los 2 modelos y acabe devolviendo el BD-D5500 ya que tenia problemas al reproducir MKV desde USB y desde allshare ya que se detenía en pequeñas pausas para cargar y cuando mejor los reproducia de todas formas se veian con pequeños brinquitos. Por lo demás parecía funcionar bien, sin embargo, el BD-C5900 no lo hace y reproduce todo sin problemas y con excelentes colores y calidad. En cuanto a las diferencias funcionales no existe ninguna hasta donde lo pude comparar. Ambos reproducen 3D y los menús aunque son distintos traen las mismísimas opciones. Ambos se basan en el mismo procesador de vídeo, y tienen las mismas especificaciones técnicas. En resumen en mi experiencia son lo mismo salvo que el BD-C5900 es del 2010 y el BD-D5500 es 2011, sin embargo al BD-C5900 todo le funciona bien.
PD. investigue en google y no soy el único que le ha pasado el problema del BD-D5500 y los mkv.
Saludos!!!