Altavoces laterales en pared trasera

Lo de phase (fase) yo creo que se debe a que puedas haber conectado mal el cable del altavoz. Compruebalo todos y si están bien conectados no le des importancia (creo que a veces suelen dar esos fallos en la calibración).

Si, la altura la veo bien y que esté más o menos cerca del mueble, es indiferente (yo lo alejaría todo lo posible y que quede bien estéticamente).
Vigila la polaridad del cableado como te dicen.

mi Pioneer cada vez que paso el micro me saca alguna fase mal y estoy mas que seguro de que están correctas, revisa por si acaso y olvidate