Me parece poco probable que los altavoces de la minicadena estuvieran en la misma posición que las torres, así que a priori diría que la colocación de los altavoces en la sala es la culpable. Pero de todos modos haz las pruebas que te comenta Keef. Estaría bien saber cual era la posición en la sala de los altavoces de la minicadena y cual la de las torres. ¿Foto?

Lo de que el AVR saque el sonido con retraso por una de las salidas es algo raro, ¿no? Yo al menos nunca había leído algo así. Pero lo que sí he visto que pasa alguna vez es que internamente el cableado de una columna esté al revés (el + al - y viceversa), y entonces estarían sonando fuera de fase y la escena se va al traste. Para comprobar si efectivamente es así, cambia los polos en una de las columnas y escucha a ver si mejora. Si quieres comprobarlo sin rastro de duda, puedes coger una pila de 1,5V y acoplarle el cable de altavoz (+ a + y - a -), el cono se moverá una única vez hacia afuera y así se quedará. Si ambos se mueven hacia afuera están en fase, si se mueven en distintas direcciones en contrafase. Ojo, no tengas el altavoz conectado a la pila mucho tiempo, es corriente continua y no les va bien, pero por 1 o 2 segundos no pasa nada, no necesitas más para ver hacia donde se mueve el cono.

Saludos.