Es correcto, son dos filosofias distintas de codificar la musica. Es con perdida por que lo ha de recodificar, no simplemente extraer. Pero ambos formatos son de altisima calidad, a prueba del murcielago audiofilo mas refinado.
Por otro lado Foobar es un software reconocido, no creo que tengas problemas. Prueba y escuchalo, aunque no creo que haya nadie capaz de disguirlo, incluso aunque fuera calidad CD.
O si consigues los discos como dices en FLAC 24/192 sera lo mismo.