Directo a lo que preguntas (que tus motivos tendrás). Sí, puedes conectar un aparato por HDMI para sacar vídeo y por óptico para sacar audio (yo tengo así conectado un receptor satélite que no saca multicanal por HDMI). En la configuración de la entrada HDMI del Yamaha tienes que decirle que el audio para "esa entrada HDMI" lo coja de la entrada óptica a la que tienes conectado el aparato.

Saludos