Hasta donde sé por mi experiencia con mi Onkyo, el pass-through lo que te permite es que pase la señal de vídeo y audio de los HDMI a la tv (conector HDMI Out, para ser más exactos) cuando el AVR está apagado.
Los altavoces del 5.1 lógicamente no suenan porque el AVR está apagado y no amplifica señal alguna.