Por lo que dices, estás metiendo alta señal por los RCA del sub, entrada de baja señal?? No deberías, desconecta ya!! Claro que notas más ganancia, pero le estás metiendo una señal excesivamente alta a esa entrada.

Haz la prueba del sonómetro que te indicaba. Realmente a oído si escuchas el bajo por encima del resto de frecuencias, está demasiado alto, excesivamente. Lo normal, es no escucharlo apenas, pues nuestro oído es mucho menos sensible a baja frecuencia, sobre todo conforme decae la presión sonora, por ello lo natural es que apenas se sienta (se dice que un sub está bien integrado y ofreciendo una respuesta plana, cuando apenas lo notas, pero si lo apagas, notas que falta). Cuestión aparte son los gustos, si te van los graves "inflados"; si es así, una vez ajustado como debe, solo has de girar más la ganancia del sub y listo.

Saludos.