El primer punto entiendo que si se refiere a lo mismo. Se trata de la frecuencia de corte a partir de la cual el sub reproducirá las frecuencias que estén por debajo de la frecuencia marcada. Normalmente suele ser 80Hz pero también depende de lo que bajen tus altavoces. Si llegan hasta 75Hz, por ejemplo, yo pondría la frecuencia de corte más alta.

Para que funcione deberías configurar los altavoces como small ya que en large reproducirían todo el rango de frecuencias. Lo mejor es que vayas probando partiendo de lo 80Hz como referencia hasta que encuentres el punto que te guste. Yo tengo un RX-V475 y el YPAO es muy básico, como el tuyo, y no demasiado exacto.

En cuanto al segundo punto no tengo ni idea. Lo siento.