En efecto, los sistemas de calibración automática, además de medir distancias, niveles, etc. realizan una "ecualización" de la sala en función de las mediciones que realiza y el algoritmo de corrección correspondiente, en este caso DCAC de Sony. En los sistemas "tradicionales" (ya sean propietarios como el de Sony o no, como Audyssey), las correcciones se hacen con más o menos "éxito", dependiendo de muchos factores entre los que está por supuesto el propio sistema e intentan "mostrar" la curva tipo que tengan registrada.
Esta curva, puede haber acabado o no con algún defecto de la sala o puede o no gustar el resultado (porque no lo ha corregido del todo o simplemente porque no nos gusta) y es ahí donde puedes hacer uso de los controles de tono.
Personalmente, creo que no es conveniente "modificar" la curva resultante, pero lo dicho dependerá del resultado y los gustos de cada uno, desde luego la calibración del receptor lo hará lo mejor que pueda, dentro de sus limitaciones del sistema, versión, gama, etc.