Creo que el comportamiento es normal... o el esperado. Sólo estás cambiando la entrada de imagen en la tv y tu home cinema no sabe que lo has hecho, por lo que creo que deberías cambiar la entrada también en el home cinema a la óptica.
Si utilizas las consolas, al estar todas por HDMI a la tv y con la entrada correspondientemente seleccionada en el home cinema, siempre le llegará el audio al home cinema pues el ARC se encarga de mandar la señal del HDMI que selecciones en la tv.