Dos cosillas: una, lo que deje el Audyssey no es "dogma de fe", primero porque no es perfecto y depende MUCHO de cómo hagas la medición (en la primera es donde mide niveles y distancias, las otras son sólo para acumular info acústica de la sala), segundo porque "para gustos colores".
Casi siempre necesitarás subir el SW de 6 a 10 dB de como lo deje, o no tendrás graves en efectos. A estas alturas dbeerían haber corregido esto, peor pasa en casi todos los sistemas de este tipo, y es que el grave medido y el percibido no son lo mismo. Y las demás cajas, repasa manualmente y aunque sea a oído (si no tienes sonómetro) si efectivamente parece que te suenan igual de volumen.

No dices qué tv usas: tal vez tenga 720p como resolución preferida, por hdmi "se lo dice" al Onkyo y éste a su vez a las fuentes conectadas. El hdmi tiene estas cosas a veces, y a veces te deja cambiar cómo se queda, otras no... El Onkyo no es ni más ni menos "sensibe" a estas cosas que otros AV.

Por otra parte el tema del volumen relativo... da un poco igual. Es decir, calibrar las cajas pongamos todas a -10, significará que tendrás que poner el volumen 10 puntos más arriba para escuchar a igual nivel. Pero la amplificación trabajará igual porque realmente da la ganancia final que es resultado de una cosa y la otra (y "-10" + "10" = 0). Es diferente si el nivel se reduce externamente, por ejemplo, un DVD con salidas analógicas multicanal en el que calibres éstas a "-10", entonces el ampli SI tendrías que dar "+10" extra de ganancia para el mismo volumen; pero si es si propia calibración interna, no, porque realmente sólo usa un circuito de control de volumen (sólo tiene uno interno por canal).

La idea es que tras calibrar, "0" de mando sean 75dB en punto de escucha. Tus cajas deben ser más eficientes de la media porque "recorta" en todas (o están más cerca del micro, o la sala es muy "viva").

Y creo que yastá... ¿Qué tal andas de temperaturas (sobre todo parte trasera derecha, donde la placa HDMI)? Sabrás que se miran dando en el forntal a "display+stanby" (ahí te sale el nº firmware) y "tone" (ahí salen las dos T).

Saludos