Por lo que veo, es un ampli con hdmi, pero que no decodifica los últimos formatos hd, de ahí que sea hdmi 1.2, pues esos formatos entraron en la especificación 1.3.
VSX-1016V-S (Archived) - Pioneer UK

Así que no hay ninguna diferencia en conectar la imagen a la tv y el audio al ampli, o conectarlo por hdmi al ampli.
La única ventaja estaría en que si lo conectas por hdmi al ampli, luego en la salida puedes poner un splitter hdmi 1x2, y así emitir la misma imagen a la tv y proyector (si es que lo necesitas), mientras que de la otra manera, tendrías que poner un splitter a cada dispositivo cuya imagen quisieras duplicar. En cuanto al sonido, sonarán igual.