Puedes probar dos cosas para centrar el problema. Uno formateas el pen en ExFAT, como ya has hecho, pero pones una pelicula que sepas seguro que si reproduce el bluray. O incluso un mp3 o fotos en jpeg. Si eso funciona el problema no es el pen ni el formato.

Lo siguiente como te comentan seria averiguar los codecs de esa pelicula en el mkv. Y si puedes, buscar una pelicula mas pequeña o un trailer con exactamente esos misos codecs a ver si va en el bluray, en un medio que sepas que reconoce, fat32... Si no va pues ya sabes, no soporta esos codecs. Tambien puedes buscar por internet que formatos exactamente reproduce ese bluray para confirmar.

Asi podras ver donde esta el problema. Aunque por lo que comentas yo apostaria a que es un problema con el codec, que igual no lo soporta el reproductor.