Supongo que es un problema de los ficheros de trabajo que almacena YaDis. Tal y como funciona la única manera que tienes de hacerlo es tener los discos conectados siempre de la misma manera cuando lo abres. Como sólo tienes un único directorio de trabajo con el Yadis no es posible exportar a más de una ubicación al no ser que lo manipules manualmente.

Hace algún tiempo en este mismo hilo se explico como se podía montar en el caso de tener varios discos pero no tenerlos siempre conectados, que es algo parecido a lo que me explicas. Te pongo el enlace por si te sirve: https://www.forodvd.com/tema/90497-d...o/index91.html (hacia la mitad más o menos, un post largo de hsiphano)