Imagino que todos sabéis las diferencias entre los formatos NTFS y Fat32
FAT32: Podréis grabar archivos de hasta 4GB
NTFS: Podréis grabar archivos de hasta 16TB
No creo existan dudas que todos formateamos con el sistema NTFS. Pero sigo pensando que el proble viene en que tenemos que eliminar el volumen que trae el disco duro (porque por defecto vienen en MBR) y hemos de convertir dicho volumen a GPT.
El motivo de la necesidad de cambiarlo es porque si el volumen está en MBR, solo permite manejar discos duros de hasta 2tb y un máximo de 4 particiones. Mientras que el GPT permite la gestión de discos duros superiores a los 2TB y realizar particiones ilimitadas.

Por experiencia própia, si no reconoce HDD superiores a 2TB, este sería el muy posible motivo.